MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 6489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016781	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016781	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016781	TAAA	2	8	1828	1835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016781	AGT	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016781	TTA	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016781	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016781	TGC	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016781	GAG	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016781	CTG	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016781	TAA	2	6	5542	5547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016781	A	6	6	7622	7627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016781	TAG	3	9	7671	7679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016781	GAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016781	AT	3	6	8125	8130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016781	ATG	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016781	TA	4	8	8187	8194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016781	GTT	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016781	CAA	2	6	8236	8241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016781	TCGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016781	TTC	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016781	T	6	6	8285	8290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016781	ATT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016781	TTA	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016781	GCT	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016781	TGC	2	6	12019	12024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016781	GTT	2	6	12089	12094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016781	GT	3	6	12099	12104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016781	AAC	2	6	12253	12258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016781	AGG	2	6	12299	12304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016781	TGT	2	6	12368	12373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016781	TCGC	2	8	12463	12470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016781	GGAT	2	8	12473	12480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016781	GAA	2	6	13212	13217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016781	CGC	2	6	13223	13228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016781	T	7	7	13261	13267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016781	GT	3	6	13327	13332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016781	GGT	2	6	13359	13364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016781	T	6	6	13376	13381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016781	GAC	2	6	13460	13465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016781	CAA	2	6	13488	13493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016781	CAT	2	6	13498	13503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016781	TTATC	2	10	14084	14093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016781	TGT	2	6	14156	14161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016781	ACGTA	2	10	14247	14256	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016781	AGG	2	6	14326	14331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016781	CAGTA	2	10	14630	14639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016781	A	6	6	17565	17570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016781	TAGCG	2	10	18329	18338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016781	GGA	2	6	18972	18977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016781	GCA	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016781	TA	3	6	19898	19903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016781	AAT	2	6	19938	19943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016781	GTT	2	6	20010	20015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016781	GAA	2	6	20100	20105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016781	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016781	TGG	2	6	20281	20286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016781	GCT	2	6	20367	20372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016781	CGA	2	6	20406	20411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016781	CAG	2	6	20559	20564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016781	AGT	2	6	21033	21038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016781	TCCC	2	8	21083	21090	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_016781	CCT	2	6	21094	21099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016781	GCC	2	6	21120	21125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016781	GTC	2	6	21126	21131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016781	GAG	2	6	21203	21208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016781	GAT	2	6	21319	21324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016781	GCA	2	6	21365	21370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016781	AGCTTC	2	12	21470	21481	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016781	CGA	2	6	21591	21596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016781	ACA	2	6	21653	21658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016781	TTTTCT	2	12	22072	22083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016781	TC	3	6	22601	22606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016781	TAT	2	6	22632	22637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016781	AAT	2	6	23703	23708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016781	AGC	2	6	23710	23715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016781	GCT	2	6	23722	23727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016781	T	6	6	23761	23766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016781	TCAT	2	8	23817	23824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016781	TGAT	2	8	23835	23842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016781	CT	3	6	23876	23881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016781	T	6	6	24022	24027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016781	TTG	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016781	GCG	2	6	27934	27939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016781	GAAG	2	8	27969	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016781	GCTA	2	8	29130	29137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016781	TC	3	6	29158	29163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016781	TAT	2	6	29176	29181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016781	TA	3	6	29536	29541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016781	GAG	2	6	37971	37976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016781	CCT	2	6	39011	39016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016781	TACT	2	8	39037	39044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016781	GCA	2	6	39073	39078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016781	TAG	2	6	39113	39118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016781	AAGA	2	8	39119	39126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016781	ATT	2	6	39332	39337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016781	CAC	2	6	39342	39347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016781	C	7	7	39421	39427	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_016781	T	6	6	39499	39504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016781	TGCG	2	8	39569	39576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016781	CACAT	2	10	39588	39597	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016781	CCT	2	6	41363	41368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016781	TTC	2	6	41369	41374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016781	ATA	2	6	41394	41399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016781	TA	3	6	41398	41403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016781	GCTG	2	8	41457	41464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016781	TGA	2	6	41527	41532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016781	AATG	2	8	44453	44460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016781	CG	3	6	44480	44485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016781	CCT	2	6	46040	46045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016781	ATT	2	6	46084	46089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016781	AAAT	2	8	46097	46104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016781	TGT	2	6	46148	46153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016781	TTGC	2	8	47826	47833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016781	AGC	2	6	47854	47859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016781	TTG	2	6	47870	47875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016781	GTT	2	6	47892	47897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016781	ATTA	2	8	47901	47908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016781	ACT	2	6	48359	48364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016781	TGG	2	6	48427	48432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016781	TAT	2	6	48441	48446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016781	T	6	6	48464	48469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016781	T	7	7	49851	49857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016781	AAG	2	6	49865	49870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016781	TTC	2	6	50025	50030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016781	TCA	2	6	50040	50045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016781	T	6	6	50127	50132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016781	A	6	6	50191	50196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016781	GTG	2	6	50229	50234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016781	TCA	2	6	50238	50243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016781	AAG	2	6	50368	50373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016781	ATC	2	6	50670	50675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016781	TGG	2	6	50849	50854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016781	CG	3	6	50861	50866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016781	AC	3	6	50875	50880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016781	GTTT	2	8	50903	50910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016781	TGT	2	6	52661	52666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016781	TTGGA	2	10	52672	52681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016781	AAC	2	6	52690	52695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016781	TTGAT	2	10	52707	52716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016781	T	6	6	54624	54629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016781	CCA	2	6	54670	54675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_016781	A	6	6	54683	54688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016781	GA	3	6	54742	54747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016781	TGG	2	6	57723	57728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016781	CAT	2	6	57768	57773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016781	AGC	2	6	57800	57805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016781	TTGG	2	8	57812	57819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016781	TGC	3	9	57867	57875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016781	CTT	2	6	59651	59656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016781	ACC	2	6	59657	59662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_016781	ACG	2	6	59672	59677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016781	GCAC	2	8	59684	59691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_016781	TTG	2	6	65969	65974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_016781	AT	3	6	76541	76546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_016781	CAG	2	6	125384	125389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_016781	GTG	2	6	125454	125459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_016781	ATAC	2	8	160823	160830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
417	NC_016781	CAGG	2	8	160843	160850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
418	NC_016781	CGG	2	6	160887	160892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_016781	A	6	6	160951	160956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_016781	GTAG	2	8	160957	160964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
423	NC_016781	ATA	2	6	161040	161045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_016781	GGTTG	2	10	161124	161133	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
426	NC_016781	CAC	2	6	161218	161223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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440	NC_016781	TGG	2	6	164415	164420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
441	NC_016781	TGTGC	2	10	164447	164456	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
442	NC_016781	GAG	2	6	164511	164516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_016781	TTC	2	6	166667	166672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_016781	ATT	2	6	169337	169342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_016781	AAG	2	6	169357	169362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_016781	TGCT	2	8	171237	171244	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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453	NC_016781	AAT	2	6	171364	171369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_016781	ATA	2	6	171388	171393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_016781	TCG	2	6	175200	175205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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